Einfach das bearbeitete Template header löschen ? Kenne mich damit nicht so aus.Weil ich habe auch Erweiterungen drin die manuell eingefügt worden sind. 
Im Anhang die headinclude.tpl
Bei Google ist die Seite mit Toyota Verso Forum drin. Seit Monaten war die Seite ohne Startseite-meine-domain.de Indexiert worden, seit ein paar Tagen mit Startseite in den Suchergebnissen.
Kurzer Nachtrag
Ich habe jetzt beim Stil auf Standardtemplate umgestellt. Leider wird immer noch die URL 2 mal angezeigt.
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.1//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml11/DTD/xhtml11.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" dir="ltr" xml:lang="de"><head>
<base href="http://www.mein-verso.de/" />
<base href="http://www.mein-verso.de/" />
<title>Startseite - Toyota Verso Forum</title>